L’année dernière, une IA a conçu pour la première fois un virus vivant capable d’éliminer Escherichia coli. Après un reportage sur la chaîne de vulgarisation scientifique « PanScience », cela a suscité de nombreux débats en ligne sur la possibilité que « Resident Evil » devienne réalité. Les experts soulignent que l’expérience a exclu tout virus pathogène pour l’humain, se concentrant sur la résolution du problème de résistance aux médicaments. Actuellement, aucune crise biochimique n’est à craindre.
Après la sortie du jeu d’horreur « Resident Evil 9 : Village of Shadows » de Capcom, qui a atteint 320 000 joueurs simultanés sur Steam, le retour de Leon et ses performances ont continué à faire parler d’eux. Cela m’a rappelé une étude scientifique de l’année dernière, liée à la conception d’un virus par IA, rapportée par la chaîne de vulgarisation « PanScience » à Taïwan, qui a fait penser aux internautes à la société pharmaceutique bio-médicale « Umbrella Corporation » de Resident Evil.
En septembre 2025, la revue scientifique de renom « Nature » a rapporté que des chercheurs avaient créé les premiers virus conçus par une IA générative, capables de traquer et d’éliminer Escherichia coli.
Le biologiste computationnel de l’Université de Stanford, Brian Hie, a déclaré que c’était la première fois qu’un système d’IA écrivait une séquence génomique cohérente. La prochaine étape sera la création de formes de vie par IA.
Son collègue Samuel King a ajouté que la conception d’un organisme vivant complet nécessiterait encore de nombreux progrès expérimentaux. Maisles recherches actuelles montrent que l’IA possède un potentiel dans la conception d’outils biotechnologiques et le traitement des infections bactériennes. Brian Hie espère que ces stratégies pourront à l’avenir renforcer les traitements ciblant des agents pathogènes spécifiques.
Comment l’IA conçoit-elle un virus ? L’équipe de recherche a utilisé les modèles linguistiques Evo 1 et Evo 2, capables d’analyser et de générer des séquences, en prenant comme modèle le virus ΦX174, un seul brin d’ADN contenant 5386 nucléotides. Après avoir entraîné ces modèles sur de nombreux génomes de phages, l’équipe a ensuite utilisé un apprentissage supervisé pour générer des génomes viraux capables d’infecter des E. coli résistants aux médicaments.
Après avoir évalué des milliers de séquences générées, les chercheurs ont sélectionné 302 phages viables. Les expériences ont confirmé que 16 d’entre eux étaient spécifiques à leur hôte, et que la combinaison de phages conçus par IA pouvait tuer trois souches différentes d’E. coli, dépassant ainsi les limites des virus sauvages originaux.
Source : Processus de conception de virus avec les modèles linguistiques Evo 1 et Evo 2
Après la diffusion par PanScience, les internautes ont rapidement fait le lien avec la société Umbrella, organisation antagoniste de Resident Evil.
Ils craignent que les entreprises pharmaceutiques ne s’engagent sur la voie de la production et de la vente incontrôlées, plaisantant en disant qu’elles envisagent d’investir dans Umbrella ou demandant où trouver le protagoniste Leon pour une éventuelle assistance. Certains s’inquiètent aussi que l’éthique humaine ne suive pas le rythme du progrès technologique, craignant qu’avant de guérir, une crise biochimique ne soit déclenchée, en plaisant : « Combien d’épisodes reste-t-il à échapper ? »
Dans Resident Evil, la société Umbrella a été fondée en 1968, prétendant être une multinationale pharmaceutique, mais en secret, elle fabriquait le virus T dans ses laboratoires à Raccoon City. En 1998, le virus s’est échappé via des rats et de l’eau contaminée, provoquant une infection généralisée et une cannibalisme. Finalement, le gouvernement américain a détruit la ville avec une bombe nucléaire, et la société a fait faillite.
Source : Resident Evil, organisation antagoniste Umbrella Corporation
Concernant les risques liés à cette technologie, le biologiste computationnel du Cold Spring Harbor Laboratory (CSHL), Peter Koo, pense que cette recherche pose les bases d’applications plus audacieuses à l’avenir.
Il souligne que, seul, le modèle ne suffit pas à générer un virus, mais qu’avec le filtrage par l’équipe et la synergie du système, cela pourrait représenter une voie pour produire des génomes fonctionnels.
Sur les questions éthiques liées à la conception de virus pathogènes par IA, la biologiste physique de l’Université de Heidelberg, Kerstin Göpfrich, estime que cette double problématique de bonnes et mauvaises applications n’est pas propre à l’IA, mais existe dans toute la biologie, où la technologie peut apporter des bénéfices ou des risques.
Le rapport indique que l’équipe a exclu de ses données d’entraînement tout virus affectant les eucaryotes, y compris l’humain. Le virus ΦX174 et le système d’E. coli utilisés sont non pathogènes, avec un historique d’utilisation sûre en biologie moléculaire.
Les chercheurs espèrent pouvoir générer en toute sécurité des virus conçus par IA, afin de répondre aux problèmes croissants de résistance bactérienne. Kerstin Göpfrich voit cette technologie comme un domaine à fort potentiel de croissance, avec beaucoup d’espoir pour le futur.
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